3D Nuclei Clustering Tool

Analysez du clustering des noyaux dans des images 3D. Les centres des noyaux sont détectés. Les noyaux sont filtrés par la présence d'un signal dans un autre canal. Le clustering est fait avec l'algorithme basé sur la densité DBSCAN. Les distances des voisins les plus proches entre tous les noyaux et ceux à l'extérieur et à l'intérieur des cluster sont calculées.

Téléchargement et plus d'informations : 3D_Nuclei_Clustering_Tool sur github

Mots-clés: 3D analysis, spheroïd, clustering, nuclei