Montpellier Ressources Imagerie (MRI)

Plate-forme d'Imagerie de la région Occitanie
Plate-forme technologique (PFT), labellisée IBiSA
Membre de France-BioImaging et Euro-BioImaging

Actualités

Bienvenue

Octobre 2022 : MRI s'implique dans "En quête de Sciences" organisée par la délégation Occitanie Est du CNRS
La plateforme a accueilli le 13 et 14 octobre des lycéens en section pro "photos" et des apprentis coiffure. Le samedi 15 octobre, le campus était ouvert au grand public. C'est toujours un grand moment de partage! Nous leur avons fait découvrir la division cellulaire sous un microscope!

Merci à notre section pro "photographie" pour leurs photos!

 

Septembre - Décembre 2022 : Ateliers MRI BioCampus
Les prochains ateliers BioCampus proposés par MRI sont:
-5 octobre: Formation FlowJo niveau débutant
-12-14 octobre: Analyse d'images-3D
-17-18 octobre: Cytométrie en flux : de la préparation des échantillons à l'analyse de données
-15-16 novembre: Les bases du logiciel OMERO
-22-24 novembre: L'apprentissage automatique ("machine learning") appliqué à l'analyse d'images biologiques

Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus

 

Juillet 2022 : Visite de Sylvie Retailleau à Montpellier - visite du plateau MRI-ISEM
La ministre de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche est venue à Montpellier rendre visite à trois sites de recherche en pointe dans le domaine de l'environnement. Ce déplacement à l'ISEM a été l'occasion de visiter le plateau de tomographie à rayons X MRI de l'ISEM en présence de Nicolas Galtier et Renaud Lebrun.

(image source : Midi Libre MAXPP - JEAN-MICHEL MART)

 

Juillet 2022 : Mise à jour du spinning disk CSU-X1 - plateau MRI-CRBM
Nous avons changé 1) les 4 lasers, ils sont 5 à 10 fois plus puissants que les anciens, 2) la caméra par une sCMOS Prime95B avec une taille de pixel plus petite que la précédente, 3) le logiciel iQ3 par le logiciel Inscoper et 4) un module (Inscoper module) qui contrôle tous les composants du microscope pour augmenter la vitesse d'acquisition. La configuration détaillée est disponible sur la page web du plateau CRBM.

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Juillet 2022 : Arrivée d'un nouveau confocal LSM980-Airyscan2 - plateau MRI-IGH
Ce microscope remplace le confocal LSM780 du plateau IGH. Au-delà de la microscopie confocale classique, le module Airyscan permet une amélioration de résolution, de sensibilité et ou de vitesse d'acquisition.

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Juin 2022 : Arrivée d'un Cytomètre en Image "Imagestream X (ISX)" - plateau MRI-IGMM
Cet appareil est la combinaison d'un cytomètre en flux et d'un microscope. L'ISX va afficher une image de votre cellule et permettre de calculer un certain nombre de paramètres statistiques liés à la taille, la forme, la texture des cellules, la localisation de la fluorescence et son intensité. Le logiciel de traitement d'image, IDEAS, propose une analyse libre et/ou par assistant pour certaines applications. Les principales caractéristiques de notre instrument sont décrites sur la page web du plateau IGMM.

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Du 15 au 17 juin 2022 : Formation "L'apprentissage automatique ("machine learning") appliqué à l'analyse d'images biologiques"
FORMATION ANNULEE PAR MANQUE D'INSCRITS. La plateforme MRI propose une formation pour comprendre et appliquer les méthodes d’apprentissage automatique pour l’analyse des images biologiques en utilisant des logiciels « libres ».

Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus

 

Mai 2022 : Arrivée d'un nouveau confocal LSM980 Airyscan 2 - plateau MRI-CRBM
Le microscope confocal SP5 a été remplacé par un microscope confocal Zeiss LSM980. Ce microscope est équipé du module Airyscan 2 pour la haute résolution et le mode Multiplex pour un balayage plus rapide. Vous trouverez la configuration détaillée sur le site web à la page du plateau CRBM.Ce microscope est piloté par Zen blue.

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Du 18 au 20 mai 2022 : Formation "Programmation de macros avec ImageJ"
La plateforme MRI propose une formation pour apprendre la rédaction de scripts dans Image J qui permettent d'automatiser un grand nombre de tâches de traitement et d'analyse d'images

Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus

 

Mai 2022 : Arrivée d'un spinning disk Olympus SORA - plateau MRI-CRBM
il s’agit d'un spinning disk, avec 4 lasers d'excitation (405, 488, 561, 640nm), un microscope inversé Olympus IX83, un module de compensation de dérive en z, 6 objectifs (dont un objectif silicium 30x NA 1.05 WD 0.73 et un objectif silicium 60x NA 1.3, WD 0.3 mm pour l'imagerie des cellules vivantes et les grandes distances de travail), et une caméra sCMOS rétro-éclairée Fusion BT Hamamatsu. L'unité du spinning est un W1 Yokogawa, couplé à un disque SoRa pour l'imagerie haute résolution (gain d'un facteur de 1,4x, plus d'infos ici : https://www.olympus-lifescience.com/fr/super-resolution/spinsr10/). La température et le CO2 sont contrôlés.

Un module de photoactivation FRAP avec deux lasers indépendants 405 et 488nm permet les expériences de photo-manipulation.

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Du 7 au 11 avril 2022 : Formation "Les bases du logiciel ImageJ"
La plateforme MRI propose une formation pour apprendre les bases d'un logiciel d'analyse d'images appelé ImageJ.Ce logiciel est libre et très utilisé dans la communauté

Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus

 

Du 14 au 17 mars 2022 : Formation "Microscopie à épi-fluorescence et microscopie confocale : de la base à la pratique"
La plateforme MRI propose une formation pour apprendre les fondamentaux de la microscopie à fluorescence champ plein et confocal.

Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus

 

Février 2022 : Arrivée d'un nouveau scanner de lames Naozoomer - plateau MRI-INM
Ce nouveau scanner de lames remplace le scanner de lames Nanozoomer existant. Les deux scanners cohabitent jusqu'à la prochaine panne du plus ancien des Nanozoomers. Vous trouverez la configuration détaillée sur le site web à la page du plateau INM.

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Novembre 2021 : MRI à Mifobio
Mifobio est l'école thématique CNRS organisée par le GDR Imabio. Il s'agit d'une école pluridisciplinaire portant sur les avancées biologiques et technologique en imagerie du vivant. Plusieurs ingénieurs MRI y ont participé et y ont organisé des ateliers pour partager leur expérience.

Plus d'images sur notre compte twitter @MRI_Montpellier et #Mifobio2021

 

Septembre 2021 : Bienvenue à Léo TELLEZ-ARENAS
Léo rejoint en CDD l'équipe du plateau du CRBM en tant qu'ingénieur en analyse d'images. Valentin a obtenu cette année son Master IMAGINA de Montpellier. Après avoir réalisé son stage de Master2 en co-encadrement avec Volker Baecker de la plateforme, il nous rejoint pour un premier emploi. Les coordonnées complètes de Léo sont dans notre annuaire.

Et encore bienvenue dans l'équipe d'ingénieurs MRI!

 

Septembre 2021 : Bienvenue à Valentin ASEI-CESCHINO
Valentin rejoint en CDD l'équipe du plateau de l'IGH en tant qu'ingénieur en microscopie. Valentin a obtenu son Master Imagerie de Lyon en 2019. Après une expérience dans le privé en région lyonnaise, il nous rejoint. Les coordonnées complètes de Valentin sont dans notre annuaire.

Et encore bienvenue dans l'équipe d'ingénieurs MRI!

 

Septembre 2021 : Bienvenue à Claire DUPONT
Claire rejoint en CDD l'équipe du plateau du CRBM en tant qu'ingénieure en microscopie. Claire a obtenu son doctorat en 2020 à l'IGMM. Après un court passage à l'IRIM, elle nous rejoint. Les coordonnées complètes de Claire sont dans notre annuaire.

Et encore bienvenue dans l'équipe d'ingénieurs MRI!

 

22-23-24 Septembre 2021 : Formation "Imagerie Avancée : Super-résolution en microscopie photonique"
La plateforme MRI propose une formation pour apprendre les fondamentaux de la microscopie de super-résolution et découvrir les techniques STED, SIM, PALM/STORM, Airyscan.

Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus

 

20-21-22 Septembre 2021 : Formation "Les bases du logiciel ImageJ"
La plateforme MRI propose une formation pour comprendre et appliquer les techniques de traitement et d'analyse dimages avec le logiciel ImageJ.

Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus