Bienvenue
Mars - Juin 2023 : Ateliers MRI BioCampus
Les prochains ateliers BioCampus proposés par MRI sont:
-6-9 mars : Microscopie à épi-fluorescence et microscopie confocale : de la base à la pratique
-4-5 avril : Cytométrie en flux : de la préparation des échantillons à l'analyse de données
-13-14-17 avril : Les bases du logiciel ImageJ
-23-25 mai : Programmation des macros avec imageJ
-19-20 juin : Imagerie avancée: Haute résolution en microscopie photonique
-juin: Les bases du logiciel OMERO
Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus
Janvier 2023 : MRI vous souhaite à toutes et tous une très bonne année!
MRI a connu une année 2022 tout à fait exceptionnelle et nous ne doutons pas que 2023, l’année des 20 ans de MRI, soit tout aussi riche en évènements! Si vous voulez connaître plus en détails les principales avancées de 2022 et ce qui est prévu pour 2023, cliquez ici.
Au plaisir de vous revoir sur les plateaux MRI!
Septembre à Décembre 2022 : Bienvenue aux nouveaux ingénieurs MRI!
Nous sommes très heureux d'accueillir de nouveaux membres dans l'équipe de MRI : Clément Croisé (apprenti en gestionnaire de parc informatique), Clément Benedetti (ingénieur en analyse d'images), Felicia Leccia (ingénieure en cytométrie) et Dominique Goubet (développeur informatique sur le projet CFMS)
Clément, Clément, Felicia, Dominique, bienvenue dans l'équipe MRI!!
Octobre 2022 : Arrivée d'un trieur spectral Aurora - plateau MRI-IRMB
Ce cytomètre trieur remplace le trieur Aria du plateau IRMB. Ce trieur basé sur la cytométrie spectrale est équipé de 4 lasers : bleu, jaune, rouge, violet et permet une séparation des fluorochromes beaucoup plus performante pouvant aller en théorie jusqu’à séparer 35 fluorochromes simultanément. Toutes les caractéristiques techniques sont sur la page dédiée
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Octobre 2022 : MRI s'implique dans "En quête de Sciences" organisée par la délégation Occitanie Est du CNRS
La plateforme a accueilli le 13 et 14 octobre des lycéens en section pro "photos" et des apprentis coiffure. Le samedi 15 octobre, le campus était ouvert au grand public. C'est toujours un grand moment de partage! Nous leur avons fait découvrir la division cellulaire sous un microscope!
Merci à la section pro "photographie" pour leurs photos!
Septembre - Décembre 2022 : Ateliers MRI BioCampus
Les prochains ateliers BioCampus proposés par MRI sont:
-5 octobre: Formation FlowJo niveau débutant
-12-14 octobre: Analyse d'images-3D
-17-18 octobre: Cytométrie en flux : de la préparation des échantillons à l'analyse de données
-15-16 novembre: Les bases du logiciel OMERO
-22-24 novembre: L'apprentissage automatique ("machine learning") appliqué à l'analyse d'images biologiques
Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus
Juillet 2022 : Visite de Sylvie Retailleau à Montpellier - visite du plateau MRI-ISEM
La ministre de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche est venue à Montpellier rendre visite à trois sites de recherche en pointe dans le domaine de l'environnement. Ce déplacement à l'ISEM a été l'occasion de visiter le plateau de tomographie à rayons X MRI de l'ISEM en présence de Nicolas Galtier et Renaud Lebrun.
(image source : Midi Libre MAXPP - JEAN-MICHEL MART)
Juillet 2022 : Mise à jour du spinning disk CSU-X1 - plateau MRI-CRBM
Nous avons changé 1) les 4 lasers, ils sont 5 à 10 fois plus puissants que les anciens, 2) la caméra par une sCMOS Prime95B avec une taille de pixel plus petite que la précédente, 3) le logiciel iQ3 par le logiciel Inscoper et 4) un module (Inscoper module) qui contrôle tous les composants du microscope pour augmenter la vitesse d'acquisition. La configuration détaillée est disponible sur la page web du plateau CRBM.
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Juillet 2022 : Arrivée d'un nouveau confocal LSM980-Airyscan2 - plateau MRI-IGH
Ce microscope remplace le confocal LSM780 du plateau IGH. Au-delà de la microscopie confocale classique, le module Airyscan permet une amélioration de résolution, de sensibilité et ou de vitesse d'acquisition.
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Juin 2022 : Arrivée d'un Cytomètre en Image "Imagestream X (ISX)" - plateau MRI-IGMM
Cet appareil est la combinaison d'un cytomètre en flux et d'un microscope. L'ISX va afficher une image de votre cellule et permettre de calculer un certain nombre de paramètres statistiques liés à la taille, la forme, la texture des cellules, la localisation de la fluorescence et son intensité. Le logiciel de traitement d'image, IDEAS, propose une analyse libre et/ou par assistant pour certaines applications. Les principales caractéristiques de notre instrument sont décrites sur la page web du plateau IGMM.
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Du 15 au 17 juin 2022 : Formation "L'apprentissage automatique ("machine learning") appliqué à l'analyse d'images biologiques"
FORMATION ANNULEE PAR MANQUE D'INSCRITS. La plateforme MRI propose une formation pour comprendre et appliquer les méthodes d’apprentissage automatique pour l’analyse des images biologiques en utilisant des logiciels « libres ».
Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus
Mai 2022 : Arrivée d'un nouveau confocal LSM980 Airyscan 2 - plateau MRI-CRBM
Le microscope confocal SP5 a été remplacé par un microscope confocal Zeiss LSM980. Ce microscope est équipé du module Airyscan 2 pour la haute résolution et le mode Multiplex pour un balayage plus rapide. Vous trouverez la configuration détaillée sur le site web à la page du plateau CRBM.Ce microscope est piloté par Zen blue.
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Du 18 au 20 mai 2022 : Formation "Programmation de macros avec ImageJ"
La plateforme MRI propose une formation pour apprendre la rédaction de scripts dans Image J qui permettent d'automatiser un grand nombre de tâches de traitement et d'analyse d'images
Vous trouverez toutes les informations sur le Site Biocampus
Mai 2022 : Arrivée d'un spinning disk Olympus SORA - plateau MRI-CRBM
il s’agit d'un spinning disk, avec 4 lasers d'excitation (405, 488, 561, 640nm), un microscope inversé Olympus IX83, un module de compensation de dérive en z, 6 objectifs (dont un objectif silicium 30x NA 1.05 WD 0.73 et un objectif silicium 60x NA 1.3, WD 0.3 mm pour l'imagerie des cellules vivantes et les grandes distances de travail), et une caméra sCMOS rétro-éclairée Fusion BT Hamamatsu. L'unité du spinning est un W1 Yokogawa, couplé à un disque SoRa pour l'imagerie haute résolution (gain d'un facteur de 1,4x, plus d'infos ici : https://www.olympus-lifescience.com/fr/super-resolution/spinsr10/). La température et le CO2 sont contrôlés.
Un module de photoactivation FRAP avec deux lasers indépendants 405 et 488nm permet les expériences de photo-manipulation.
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