À propos du MRI-CIA

MRI Center for Image Analysis (MRI-CIA)

MRI-CIA a été créé pour répondre aux besoins des utilisateurs de MRI en matière d'analyse d'images biologiques. Nous offrons un soutien complet pour l'analyse des images biologiques, depuis le début d'un projet de recherche jusqu'à la publication. Le soutien que nous fournissons est adapté à chaque cas individuel et peut inclure une formation individuelle au logiciel ou la création d'outils d'analyse personnalisés. Nous prenons en charge différents aspects de l'analyse d'images, comme par exemple (liste non exhaustive) :

  • traitement des données d'image
  • restauration et Recalage d'images
  • l'analyse quantitative d'images et la visualisation
  • segmentation et tracking
  • quantification morphologique et d'intensité
  • analyse de la colocalisation et statistiques spatiales

MRI-CIA collabore étroitement avec les autres ingénieurs du centre d'IRM afin de garantir des modalités d'acquisition d'images optimales pour l'analyse quantitative en aval.

Contact : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

Pour plus d'informations, cliquez ici : The MRI image analysis service.pdf

PERSONNEL

volker2
Responsable du
plateau MRI-CIA
clement
Ingénieur en
analyse d'image
thibault
Apprenti M2

Logiciels et outils

La plate-forme met a disposition des logiciels commerciaux pour l'analyse de données, des logiciels open source et des solutions développées sur la plate-forme MRI. Nous fournissons également l'accès à des solutions de deep-learning, y compris l'apprentissage (training) sur nos machines.

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MRI Center For Image Analysis

L'analyse d'images et de données est une partie importante des projets de recherche basés sur l'imagerie. MRI fournit des conseils, des formations et l'infrastructure nécessaire. Nous développons également pour vous des plugins d'analyses d'images personnalisés.

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file info line2À PROPOS DE MRI-CIA

Nous offrons un soutien complet pour l'analyse des images biologiques, depuis le début d'un projet de recherche jusqu'à la publication. Le soutien que nous fournissons est adapté à chaque cas individuel et peut inclure une formation individuelle au logiciel ou la création d'outils d'analyse personnalisés.

door open line1SESSIONS OPEN-DESK

Vous avez des questions sur l'analyse d'images ? Vous avez besoin d'aide pour un script ou une macro ? Vous envisagez de démarrer un projet d'analyse d'images avec nous ? Alors rejoignez-nous à la prochaine session open-desk.

window 2 fillLOGICIELS ET OUTILS
La plate-forme met a disposition des logiciels commerciaux pour l'analyse de données,  des logiciels open source et des solutions développées sur la plate-forme même. Nous fournissons également l'accès à des solutions deep-learning, y compris le training sur nos machines.

propriétaire     libre     apprentissage profond     outils

STATIONS D'ANALYSE
Nos stations d'analyse sont équipées avec des logiciels commerciaux et libres. Vous pouvez faire une réservation pour un poste de travail ici.

 crbm      dbs     igh     inm      isem      Lagaillarde      Lavalette 

 FORMATION ET CONSEIL

Les différents plateaux proposent des sessions "Call for Help" libres d'accès pour les utilisateurs de la plate-forme.
Vous pouvez aussi nous contacter pour des formations et conseils. La plate-forme propose aussi différents ateliers dans le cadre des ateliers techniques de Biocampus.

 SUCCESS STORIES

Exemples de projets d'analyse MRI réussis.

 GESTION DES DONNÉES

 Les données peuvent être transférées  depuis les plateaux via un serveur sFTP. Pour l'exploitation scientifique des images la plate-forme met à disposition un serveur OMERO.

LIENS ET TUTORIELS

Liens vers des didacticiels et d'autres ressources utiles en matière d'analyse d'images.

Sessions Open-Desk

Vous avez des questions sur l'analyse d'images ? Vous avez besoin d'aide pour un script ou une macro ? Vous envisagez de démarrer un projet d'analyse d'images avec nous ? Alors rejoignez-nous à la prochaine session open-desk. L'accès est gratuit et aucune inscription n'est nécessaire, mais nous vous demandons de bien vouloir nous donner quelques informations qui nous aideront à planifier les sessions.

Les prochaines sessions sont les suivantes (veuillez cliquer sur une date pour accéder à l'inscription) :

Vous avez besoin d'un QR-code et d'une pièce d'identité pour entrer sur le campus. Vous pouvez demander la création d'un QR-code ici. Vous devez sélectionner CRBM-MRI comme laboratoire à visiter et "Volker Baecker" comme approbateur. Si vous n'avez pas d'accès , demandez le QR-code par e-mail à Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser..

L'IGMM est le bâtiment situé à côté du CRBM.