Les bases du logiciel ImageJ

• Formation théorique et pratique :
  • Affichage de l’image
    • affichage, niveaux, ajustements du contraste et de la luminosité, changer de palette / LUT
  • Prétraitement de l’image
    • gestion du bruit électronique, suppression du bruit de fond, augmentation de la netteté -unsharp masking, enlever des signaux parasites- seuillage et utilisation de masques
  • Logiciels de traitement et d’analyse de l’image gratuits ImageJ

•  Colocalisation
• Types d’image et formats
  • résolution, conversions rgb color, 8 bit grayscale, 16 bit grayscale et 32 bit grayscale
    images, format fichiers tiff , jpeg, etc.
• Analyse d’image
  • Compter des objets
    • ex. noyaux, adhésions focales, vésicules
  • Mesurer des tailles et distances, mesurer et comparer des intensités
  • Détecter et classer des objets
  • Annotation d’images
  • Manipulation de piles d’images 3D ou 2D
    • construire un stack, manipuler les stacks, créer des films, des
      animations et des rendus 3D

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