Ateliers

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MRI crée et organise régulièrement des ateliers liés à l'analyse d'images et de données. Ces ateliers font partie des ateliers proposés par Biocampus Montpellier.

Apprentissage automatique appliqué à l'analyse d'images biologiques

Apprentissage automatique appliqué à l'analyse d'images biologiques

Durée : 2,5 jours, soit 17,5 heures
Objectif : Comprendre et appliquer les méthodes d'apprentissage automatique pour l'analyse d'images biologiques à l'aide de logiciels "libres".
Pré-requis : Connaître les bases de l'analyse d'images
Public : Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants.

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Les bases du logiciel ImageJ

  • Formation théorique et pratique :
    • Affichage de l’image
      • affichage, niveaux, ajustements du contraste et de la luminosité, changer de palette / LUT
    • Prétraitement de l’image
      • gestion du bruit électronique, suppression du bruit de fond, augmentation de la netteté -unsharp masking, enlever des signaux parasites- seuillage et utilisation de masques
    • Logiciels de traitement et d’analyse de l’image gratuits ImageJ

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Programmation de macros avec ImageJ

Dans cet atelier, vous allez apprendre à écrire et à utiliser les macros pour l’automatisation des tâches d’analyse d’images avec le logiciel du domaine public ImageJ. Idéalement, vous avez déjà utilisé Image J avant mais vous savez rien ou très peu sur la programmation. Si nécessaire, vous pouvez découvrir Image J dans le même temps que vous appreniez la macro programmation et si vous êtes déjà un programmeur spécialisé, vous pouvez toujours trouver des informations sur la façon de travailler sur des objets spécifiques avec ImageJ.

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