La plate-forme met a disposition des logiciels commerciaux pour l'analyse de données, des logiciels open source et des solutions développées sur la plate-forme MRI. Nous fournissons également l'accès à des solutions de deep-learning, y compris l'apprentissage (training) sur nos machines.
Solution unique pour l'analyse de flux et l’analyse avancée de données. Compatible avec tous les fichiers de données de cytomètres.
Flowing Software est un logiciel gratuit d'analyse de données de cytométrie en flux pour Windows. Il combine l'analyse de données à haut débit avec la facilité d'utilisation de Flowing. L'interface visuelle facile à utiliser assure une analyse efficace des données avec votre ordinateur personnel !
Harmony permet l'analyse hors ligne des images provenant du microscope automatisé Opera. Conçue pour les biologistes, l'interface de Harmony basée sur le flux de travail rend l'ensemble du processus d'analyse à haut contenu simple, même pour les nouveaux utilisateurs ayant peu de connaissances en microscopie ou en programmation.
Logiciel dédié aux analyses d’images provenant de système d’acquisition automatisé sur plaques. Permet des mesures dynamiques au niveau de la cellule, du champ et du puits.
Logiciel de déconvolution d’images, de visualisation et d’analyse d’images.
Logiciel de traitement et d’analyse d’images 2D et 3D. Fonctionne par l’intermédiaire de plugins et à l’aide de la programmation graphique pour créer ses propres protocoles d’analyse. Possibilité de réaliser des macros en python et javascripts.
ILASTIK solution OPEN SOURCE Tirez parti des algorithmes d'apprentissage automatique pour segmenter, classer, suivre et compter facilement vos données expérimentales.
Logiciel de reconstruction et d’analyse d’images 3D et 4D. Se compose de modules communs comme le rendu surfacique, le tracking etc, et de modules spécifiques (en nombre limité) comme imarisXT, Filament tracer, ou Cell. Interfacage possible avec FIJI et matlab par le module XT.
Logiciel d’analyse des images STED. Permet la visualisation et manipulation des images multidimensionnelles ABBERIOR.
L'outil calcule le rapport de l'intensité dans le noyau et le cytoplasme. Il a besoin de deux images en entrée: le canal du cytoplasme et le canal du noyau. Le canal des noyaux est utilisé pour segmenter les noyaux. Les mesures sont effectuées dans le canal du cytoplasme après correction de l'intensité de fond.
Téléchargement et plus d'informations : Intensity Ratio Nuclei Cytoplasm Tool sur github